Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Vps8Q0P5W1 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms