Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms