Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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