Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RhoP15409 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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RhoP15409 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RhoP15409 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RhoP15409 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RhoP15409 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RhoP15409 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms