Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TtrP07309 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TtrP07309 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms