Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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H2-Q1O19441 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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H2-Q1O19441 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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H2-Q1O19441 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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H2-Q1O19441 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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H2-Q1O19441 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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H2-Q1O19441 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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H2-Q1O19441 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-Q1O19441 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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