Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Casq1O09165 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Casq1O09165 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms