Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms