Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc6D3YZP9 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms