Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rabgef1Q9JM13 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rabgef1Q9JM13 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rabgef1Q9JM13 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rabgef1Q9JM13 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rabgef1Q9JM13 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rabgef1Q9JM13 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Rabgef1Q9JM13 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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Rabgef1Q9JM13 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Rabgef1Q9JM13 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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Rabgef1Q9JM13 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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