Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms