Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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