Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Atg3Q9CPX6 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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