Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms