Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.4 ms