Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
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