Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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