Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ccdc18Q640L5 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ccdc18Q640L5 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Ccdc18Q640L5 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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Ccdc18Q640L5 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Ccdc18Q640L5 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Ccdc18Q640L5 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Ccdc18Q640L5 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Ccdc18Q640L5 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Ccdc18Q640L5 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc18Q640L5 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc18Q640L5 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc18Q640L5 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc18Q640L5 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc18Q640L5 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc18Q640L5 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc18Q640L5 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc18Q640L5 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc18Q640L5 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc18Q640L5 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc18Q640L5 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc18Q640L5 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc18Q640L5 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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