Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm28047Q3US59 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms