Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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