Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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Sh3bp1P55194 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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Sh3bp1P55194 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Sh3bp1P55194 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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Sh3bp1P55194 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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Sh3bp1P55194 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Sh3bp1P55194 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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Sh3bp1P55194 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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Sh3bp1P55194 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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