Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxa2P31245 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms