Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprmP28828 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprmP28828 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprmP28828 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms