Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RxraP28700 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RxraP28700 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RxraP28700 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RxraP28700 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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