Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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