Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
P10404 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
P10404 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
P10404 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
P10404 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
P10404 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
P10404 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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