Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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