Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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