Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms