Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms