Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms