Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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Col5a3Q9JLI2 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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Col5a3Q9JLI2 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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Col5a3Q9JLI2 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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Col5a3Q9JLI2 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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Col5a3Q9JLI2 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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Col5a3Q9JLI2 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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