Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms