Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms