Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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Sgo1Q9CXH7 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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Sgo1Q9CXH7 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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Sgo1Q9CXH7 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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Sgo1Q9CXH7 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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Sgo1Q9CXH7 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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Sgo1Q9CXH7 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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Sgo1Q9CXH7 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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Sgo1Q9CXH7 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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Sgo1Q9CXH7 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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Sgo1Q9CXH7 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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Sgo1Q9CXH7 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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Sgo1Q9CXH7 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sgo1Q9CXH7 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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