Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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