Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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