Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Klhdc9Q3USL1 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms