Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Cpne9Q1RLL3 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms