Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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