Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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Sh3bp1P55194 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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Sh3bp1P55194 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms