Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtpreP49446 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtpreP49446 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms