Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Hoxd10P28359 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Hoxd10P28359 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Hoxd10P28359 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Hoxd10P28359 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Hoxd10P28359 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Hoxd10P28359 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Hoxd10P28359 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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Hoxd10P28359 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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Hoxd10P28359 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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Hoxd10P28359 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms