Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxb2P0C1T1 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxb2P0C1T1 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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