Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc180J3QNE4 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc180J3QNE4 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc180J3QNE4 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc180J3QNE4 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc180J3QNE4 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms