Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Brpf1B2RRD7 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms