Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms