Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rtf1A2AQ19 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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