Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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Rabgef1Q9JM13 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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Rabgef1Q9JM13 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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