Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms